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Species inventory of ectomycorrhizal fungi in a suburban secondary forest in the northwestern part of Tama area, Tokyo, Japan

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dataset
posted on 2023-01-19, 10:00 authored by Makoto Shirakawa, Akira Ishikawa, Takurou Fuchigami, Megumi Tanaka

To assess ectomycorrhizal (ECM) fungal diversity in a suburban secondary forest, we collected 766 samples (436 fungal sporocarps, 327 ECM root tips, and 3 sclerotia) from a site dominated by Quercus serrata in Ome Forest (35°47′40″N, 139°16′07″E), Tokyo, Japan, during 2016–2018. The samples obtained were identified using morphological and DNA barcoding-based analyses. 


These files are a species inventory of ECM fungi, including some saprotrophic and endophytic taxa, from the study site and some of the photographs documenting them.


Please see the manuscript (in Japanese) for more detail.



  

Abbreviations and Symbols:


ECM_Pd, ECM root tips of Pinus densiflora; ECM_Qs, ECM root tips of Quercus serrata; ECM_SS, ECM root tips from soil samples; Acc._no., Accession number; Ref._no., reference accession numbers used in species identification; *1, species identification based solely on morphological characters; *2, collected sclerotia; *3, holotype; P, presence; A, absence; N/A, not applicable

Funding

Search for ectomycorrhizal fungal resources as a foothold for introduction of hardwood

Japan Society for the Promotion of Science

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The Tokyu Foundation

History

Corresponding author email address

mk.shirakawa@gmail.com

Translated title

東京都多摩地域北西部の都市近郊二次林における外生菌根菌類のインベントリー

Translated description

都市近郊二次林における外生菌根菌(以下、菌根菌)の種多様性を明らかにするために、2016年から2018年にかけて、東京都青梅市のコナラを優占樹種とする二次林(35°47′40″N、139°16′07″E)から766サンプル(子実体436個、菌根327根端、菌核3個)を採取した。得られたサンプルは形態分類とDNAバーコーディングにより種同定を行った。 これらのデータは当該地域における菌根菌類のインベントリー(一部腐生菌および内生菌を含む)と、代表的な菌種の形態写真である。 詳細については論文を参照されたい。 略称と記号: ECM_Pd、アカマツの菌根;ECM_Qs、コナラの菌 根;ECM_SS、土壌サンプルから採取した菌;Acc._no.、 アクセッションナンバー;Ref._no.、種同定に用いたアクセッションナンバー;*1、形態分類のみに基づく種同 定;*2、併せて菌核を採取;*3、ホロタイプ;P、在;A、不在;N/A、該当なし

Translated manuscript title

東京都多摩地域北西部の広葉樹二次林における外生菌根菌の種多様性評価

Translated authors

白川誠・石川陽・渕上拓朗・田中恵

Copyright

© 2022 Makoto Shirakawa, Akira Ishikawa, Takurou Fuchigami, Megumi Tanaka